มะเร็งอวัยวะเพศชายเริ่มต้นในหรือบนอวัยวะเพศชาย มะเร็งเริ่มต้นเมื่อเซลล์เริ่มเติบโตจนควบคุมไม่ได้ องคชาตเป็นอวัยวะภายนอกของเพศชาย นอกจากนี้ยังเป็นส่วนหนึ่งของระบบทางเดินปัสสาวะ ประกอบด้วยเนื้อเยื่อในร่างกายหลายประเภท รวมถึงผิวหนัง เส้นประสาท กล้ามเนื้อเรียบ และหลอดเลือด